<div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Jim,<div><br></div><div>What version of pymongo and mongodb do you have on your system? You can check with: rpm -qa | grep mongo.</div><div><br></div><div>I think you could make the following fix in /usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/migrations/0029_applicability_schema_change.py:</div><div><br></div><div><a href="https://gist.github.com/04eed3d374a01cad34cbe97bb1222794">https://gist.github.com/04eed3d374a01cad34cbe97bb1222794</a><br></div><div><br></div><div>Also, make sure you remove 0029_applicability_schema_change.pyc and 0029_applicability_schema_change.pyo (if they exist).</div><div><br></div><div>If this works for you, please report back.</div><div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><br></div><div>David<br></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div></div></div></div></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Tue, Dec 4, 2018 at 4:08 PM Jim Davis <<a href="mailto:JDavis@douglas.co.us">JDavis@douglas.co.us</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">





<div lang="EN-US" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div class="m_-2645311957802021404WordSection1">
<p class="MsoNormal">The yum update worked without errors but the db migration failed. Any ideas from the output??<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal"># sudo -u apache pulp-manage-db<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Attempting to connect to localhost:27017<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Attempting to connect to localhost:27017<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Write concern for Mongo connection: {}<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading content types.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading type descriptors [deb.json]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Parsing type descriptors<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Validating type descriptor syntactic integrity<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Validating type descriptor semantic integrity<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: modulemd_defaults = pulp_rpm.plugins.db.models:ModulemdDefaults<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: erratum = pulp_rpm.plugins.db.models:Errata<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: distribution = pulp_rpm.plugins.db.models:Distribution<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: srpm = pulp_rpm.plugins.db.models:SRPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_group = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageGroup<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_category = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageCategory<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: iso = pulp_rpm.plugins.db.models:ISO<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_environment = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageEnvironment<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: drpm = pulp_rpm.plugins.db.models:DRPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_langpacks = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageLangpacks<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: modulemd = pulp_rpm.plugins.db.models:Modulemd<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: rpm = pulp_rpm.plugins.db.models:RPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: yum_repo_metadata_file = pulp_rpm.plugins.db.models:YumMetadataFile<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: puppet_module = pulp_puppet.plugins.db.models:Module<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_manifest = pulp_docker.plugins.models:Manifest<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_blob = pulp_docker.plugins.models:Blob<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_manifest_list = pulp_docker.plugins.models:ManifestList<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_image = pulp_docker.plugins.models:Image<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_tag = pulp_docker.plugins.models:Tag<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: python_package = pulp_python.plugins.models:Package<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: ostree = pulp_ostree.plugins.db.model:Branch<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb_release = pulp_deb.plugins.db.models:DebRelease<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb = pulp_deb.plugins.db.models:DebPackage<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb_component = pulp_deb.plugins.db.models:DebComponent<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading auxiliary model: erratum_pkglists = pulp_rpm.plugins.db.models:ErratumPkglist<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Updating the database with types [deb, deb_component, deb_release]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Found the following type definitions that were not present in the update collection [puppet_module, erratum, ostree, modulemd_defaults, docker_manifest, python_package, drpm, distribution, srpm, package_group, docker_blob, package_category,
 iso, package_environment, docker_tag, package_langpacks, modulemd, rpm, yum_repo_metadata_file, docker_image, docker_manifest_list]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Updating the database with types [puppet_module, deb, drpm, package_environment, rpm, docker_image, deb_component, python_package, srpm, package_category, package_langpacks, modulemd_defaults, docker_blob, deb_release, package_group, docker_tag,
 yum_repo_metadata_file, docker_manifest_list, ostree, erratum, docker_manifest, modulemd, iso, distribution]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Content types loaded.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Ensuring the admin role and user are in place.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Admin role and user are in place.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Beginning database migrations.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: modulemd_defaults = pulp_rpm.plugins.db.models:ModulemdDefaults<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: erratum = pulp_rpm.plugins.db.models:Errata<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: distribution = pulp_rpm.plugins.db.models:Distribution<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: srpm = pulp_rpm.plugins.db.models:SRPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_group = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageGroup<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_category = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageCategory<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: iso = pulp_rpm.plugins.db.models:ISO<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_environment = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageEnvironment<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: drpm = pulp_rpm.plugins.db.models:DRPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: package_langpacks = pulp_rpm.plugins.db.models:PackageLangpacks<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: modulemd = pulp_rpm.plugins.db.models:Modulemd<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: rpm = pulp_rpm.plugins.db.models:RPM<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: yum_repo_metadata_file = pulp_rpm.plugins.db.models:YumMetadataFile<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: puppet_module = pulp_puppet.plugins.db.models:Module<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_manifest = pulp_docker.plugins.models:Manifest<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_blob = pulp_docker.plugins.models:Blob<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_manifest_list = pulp_docker.plugins.models:ManifestList<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_image = pulp_docker.plugins.models:Image<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: docker_tag = pulp_docker.plugins.models:Tag<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: python_package = pulp_python.plugins.models:Package<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: ostree = pulp_ostree.plugins.db.model:Branch<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb_release = pulp_deb.plugins.db.models:DebRelease<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb = pulp_deb.plugins.db.models:DebPackage<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading unit model: deb_component = pulp_deb.plugins.db.models:DebComponent<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Loading auxiliary model: erratum_pkglists = pulp_rpm.plugins.db.models:ErratumPkglist<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Applying pulp.server.db.migrations version 29<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">*******************************************************************************<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Applying migration pulp.server.db.migrations.0029_applicability_schema_change failed.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Halting migrations due to a migration failure.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">command SON([('dropIndexes', u'repo_profile_applicability'), ('index', 'profile_hash_-1_repo_id_-1')]) on namespace pulp_database.$cmd failed: index not found with name [profile_hash_-1_repo_id_-1]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">Traceback (most recent call last):<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/manage.py", line 239, in main<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    return _auto_manage_db(options)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/manage.py", line 306, in _auto_manage_db<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    migrate_database(options)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/manage.py", line 135, in migrate_database<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    update_current_version=not options.test)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/migrate/models.py", line 189, in apply_migration<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    migration.migrate()<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/pulp/server/db/migrations/0029_applicability_schema_change.py", line 52, in migrate<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    rpa_collection.drop_index("profile_hash_-1_repo_id_-1")<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pymongo/collection.py", line 1456, in drop_index<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    allowable_errors=["ns not found"])<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pymongo/collection.py", line 205, in _command<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    read_concern=read_concern)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pymongo/pool.py", line 211, in command<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    read_concern)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pymongo/network.py", line 100, in command<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    helpers._check_command_response(response_doc, msg, allowable_errors)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">  File "/usr/lib64/python2.7/site-packages/pymongo/helpers.py", line 196, in _check_command_response<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">    raise OperationFailure(msg % errmsg, code, response)<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal">OperationFailure: command SON([('dropIndexes', u'repo_profile_applicability'), ('index', 'profile_hash_-1_repo_id_-1')]) on namespace pulp_database.$cmd failed: index not found with name [profile_hash_-1_repo_id_-1]<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
Pulp-list mailing list<br>
<a href="mailto:Pulp-list@redhat.com" target="_blank">Pulp-list@redhat.com</a><br>
<a href="https://www.redhat.com/mailman/listinfo/pulp-list" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.redhat.com/mailman/listinfo/pulp-list</a></blockquote></div>